孕期亲子鉴定主要有采取穿刺取羊水、胎儿绒毛、无创胎儿亲子鉴定四种方式，羊水和绒毛在采集样本的时候会对胎儿和孕妇造成伤害，现在基本被淘汰了。无创孕期亲子鉴定由于不会对胎儿和孕妇造成任何伤害，并且怀孕5周以上就可以检测，目前孕期亲子鉴定基本上选择无创胎儿亲子鉴定。
一、孕期羊水亲子鉴定
怀孕周期：怀孕4-8个月(16-32周)之间，那时子宫里有大量的羊水
采集方式：采取穿刺的方式抽出3-5毫升羊水
不良后果：可能会导致早产或者胎儿在子宫内死亡
二、孕期胎儿绒毛亲子鉴定
怀孕周期：怀孕10-13周左右进行
采集方式：在B超的监控下，通过手术采集胎儿绒毛样本
不良后果：可能导致胎儿畸形或流产
无创孕期亲子鉴定
怀孕周期：怀孕5周以上
采集方式：抽取孕妇10ml外周血
不良后果：没有任何痛苦，没有任何风险，不会对孕妇和胎儿造成任何伤害
三、无创孕期亲子鉴定流程
1. 孕妇血液的采集：必须由护士或者法医用专用采血工具进行采集和保存，个人绝对不容许私自采集，一般抽取孕妇手臂10ml静脉血即可。
2. 疑似父样本采集：疑似父样本可以是血液，带毛囊毛发，口腔棉签，指甲，牙刷，烟蒂，精液等。
3. 鉴定时间：普通检测7天内出鉴定结果，如果加急，可以二十四小时内出鉴定结果，同时检测费用要增加不少。
四、孕期亲子鉴定结果准确率
不论哪种方式，只要能提取到胎儿的DNA，那么亲子鉴定结果的准确率大于99.99%。根据孟德尔遗传定律，孩子全部遗传基因来源于其亲生父母双方。
五、原理
无创产前亲子鉴定，利用新一代高通量测序平台对母体外周血中的游离DNA片段（包括胎儿游离DNA）进行测序、生物信息分析，从中获取胎儿的DNA遗传信息，同时，根据孟德尔遗传规律比对分析假定父亲DNA信息来实现亲子关系的鉴定。采用捕获方法富集SNP位点数约13000个。
六、本人经验总结
以目前的技术理论，技术设备，分析软件，行业检测标准，实验室检测人员的专业度综合来看，产前亲子鉴定的准确率是有保障的，目前准确率总体大于99.9999%。
无创胎儿亲子鉴定技术在国内兴起于2014年，随后几年得以快速发展，鉴定机构如雨后春笋般冒出来。2014年从事无创胎儿亲子鉴定后，初步统计，本人经手的检测大概有800多例，从鉴定结果来说，目前没有发现一起出生后鉴定结果与出生前不一致的案例。所以从理论和实际数据来看，无创胎儿亲子鉴定的准确率是有充分保障的。
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隐私保护
| 鉴定类型 | 亲子鉴定样本 | 检测身份 | 检测周期 | 鉴定费用 | 备注 |
| 个人（隐私）亲子鉴定 | 血痕、囗腔棉签, 毛发、烟头 | 父（母）子，女二联体 | 3天 | 1000-2000/样本 | PP28位点超精确检测 |
| 精斑、口香糖等样本 | 父母子三联体 | 3天 | PP28位点超精确检测 | ||
| DNA亲子鉴定 | 血痕、囗腔棉签、毛发、烟头 | 父（母）子，女二联体 | 3天 | 1000-1800/样本 | PP28位点超精确检测 |
| 精斑、口香糖等样本 | 父母子三联体 | 5天 | PP28位点超精确检测 | ||
| 亲缘鉴定 | 血痕、血液 | 叔侄、爷孙等近亲属 | 5天 | 1500-2500/样本 | 常规检材 |
| 无创胎儿亲子鉴定 | 血液、指甲、精斑等样本 | 女方、疑父 | 3-5天 | 4500/样本 | 孕期5周以上，检测13000个位点 |
| 特殊样本检测 | 烟蒂、指甲、精斑 | 任一个人 | 3天 | 1400-2000/样本 | 口香糖、口杯、吸管、肌肉组织、经血、鼻血、纯精斑、胎儿流产物 |
| 精斑、血斑 | 精斑、血斑 | 特定检材 | 3天 | 500-1600/样本 | 人精斑、人血斑 |
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